純科學的主要領域

• 細菌學：細菌研究
• 真菌學：真菌研究（無葉藻，異養，真核，帶有含有幾丁質/纖維素的剛性細胞壁）
• 原生動物學：原生動物（像單細胞真核生物一樣的動物）的研究。
• 病毒學：研究病毒和病毒性疾病。
• 藻類學或植物學：研究藻類。
• 寄生蟲學：研究寄生蟲和寄生蟲（包括致病性原生動物，蠕蟲蠕蟲和某些昆蟲）。
• 微生物生態學：研究微生物與環境之間的相互關系。
• 微生物形態：研究微生物的詳細結構。
• 微生物分類法：與微生物的分類，命名和鑒定有關。
• 微生物生理學：研究微生物在細胞和分子水平上的代謝。
• 微生物遺傳學和分子生物學：研究涉及代謝和生長的微生物細胞的遺傳物質，結構和功能以及生化反應。

應用微生物學的主要領域

• 工業微生物學：與微生物在酒精飲料，維生素，NH2酸，酶，抗生素和其他藥物生產中的工業用途有關。
• 農業微生物學：研究微生物與農作物之間的關系以及控制植物病害和提高產量。
• 食品微生物學：涉及微生物和食品在食品加工，食品變質，食源性疾病及其預防方面的相互作用
• 乳制品微生物學：從事乳制品質量控制的生產和維護。
• 水生微生物學：研究在新鮮河口和海水中發現的微生物。
• 空氣微生物學：處理氣孢菌在食物污染和變質以及通過空氣傳播動植物疾病方面的作用。
• 外微生物學：研究外層微生物的生命。
• 醫學微生物學：疾病的病原體，病原體的診斷程序，預防措施。
• 免疫學：處理防止感染的免疫系統并研究血清學反應。
• 公共衛生微生物學：關注社區疾病的監測，控制和傳播。
• 生物技術：特別是在分子和遺傳水平上對生物的科學操縱，以生產有用的產品。